Trên cánh đồng rộng lớn của Gensoukyo, một bí mật đen tối đang âm thầm vươn lên. Reimu - nữ thần phù thủy - đã phát hiện những dấu vết và chỉ còn ít thời gian để ngăn chặn sự hủy diệt.
Hoa Thỏ đỏ rực rỡ nở khắp nơi, tạo nên một bức màn mê hoặc đầy ảo ảnh. Trong lúc truy tìm tung tích của sự hủy diệt, Reimu gặp Alice - nữ pháp sư tài năng với bí mật không thể nói ra. Hai người phải cùng hợp tác để tìm ra nguyên nhân và đối mặt với mối đe dọa chưa từng có.
Khi cả hai tiến xa vào thế giới tăm tối, họ nhận ra rằng sự phá hủy không chỉ đến từ bên ngoài mà còn tồn tại bên trong chính họ. Quá khứ đen tối bắt đầu bộc lộ, tâm hồn họ dần chìm trong lo sợ và nghi ngờ.
Sự truy đuổi giữa thị trấn an toàn và vực sâu quỷ dữ sắp bùng nổ, và chỉ có bằng lòng hi sinh và tình bạn chân thành, Reimu và Alice mới có cơ hội chống lại sự hủy diệt và giải cứu Gensoukyo khỏi vực thẳm của ác mộng.
