Truyện "Mirumo De Pon!" bắt đầu khi cô học sinh trung học Kaede và bạn trai cũng là bạn thân của mình, Takumi, tình cờ phát hiện một chiếc hộp đầy những viên bi kỳ lạ trong căn phòng ẩn của trường. Không ngờ rằng, khi đặt bi vào trong nước và hát một bài hát cổ điển, một nhóc tinh tinh nho nhỏ xuất hiện và tự giới thiệu mình là Mirumo. Mirumo kể với họ về cuộc chiến giữa thế giới nhỏ bé của nhóc tinh và những phù thủy tà ác đang muốn chiếm lấy năng lượng từ thế giới loài người.
Mặc dù vô cùng sốc và không tin vào điều đó, Kaede và Takumi buộc phải tin vào sức mạnh của Mirumo khi họ bị cuốn vào cuộc phiêu lưu ly kỳ giữa hai thế giới. Những tình tiết bất ngờ, những hiểm nguy đe doạ và sự phải đối diện với quyết định đầy khó khăn khiến cho tình cảm giữa họ càng trở nên phức tạp. Liệu họ có thể vượt qua tất cả, bảo vệ cả hai thế giới và giữ vững tình bạn của mình hay không? Sự hấp dẫn và éo le của cuộc phiêu lưu này giờ đây chỉ mới bắt đầu.
