Trên hòn đảo xa xôi nơi vùng biển bao la, học sinh trường trung học Kiranagi tình cờ phát hiện ra một lớp học bí ẩn mang tên "Torikago Gakkyuu" - Lớp học Ngục tù. Họ được mời tham gia vào lớp học độc đáo này và chỉ có thể rời đi sau khi giải quyết được một loạt các bí ẩn kỳ lạ.
Sakura, một cô học sinh mồ côi mang theo bí mật về thân thế của mình, cùng với Yuto, chàng trai thông minh nhưng lạnh lùng, đã quyết tâm khám phá sự thật đằng sau "Torikago Gakkyuu". Trên đường tìm kiếm, họ phát hiện ra rằng mỗi học sinh tham gia đều mang trong mình một khao khát ẩn giấu, và mỗi bí ẩn được giải quyết là một phần của cuộc sống và quá khứ của họ.
Tuy nhiên, khi họ tiến sâu vào vùng ngục tối tăm của lớp học này, họ chợt nhận ra rằng mọi thủ đoạn và điều bí ẩn không chỉ đến từ bên trong lớp học, mà còn từ quá khứ kinh hoàng đan xen với hiện tại. Một âm mưu khủng khiếp đang dần hé mở, và để thoát khỏi "Torikago Gakkyuu", Sakura và Yuto phải hợp tác vượt qua những khó khăn, phản bội và sự đau đớn đeo bám theo từng bí ẩn.
