Trong một thế giới nơi ma thuật và khoa học giao thoa, Accelerator, kẻ có sức mạnh vô song, đối đầu với một tổ chức tội phạm nguy hiểm. Trong một trận chiến gay cấn, Accelerator bất ngờ bị mắc kẹt trong một khối thời gian pararel, nơi mà quy tắc vận hành khác biệt hoàn toàn. Để thoát khỏi, anh buộc phải hợp tác với một nữ pháp sư mạnh mẽ, Esther, người nhưng mang theo một quá khứ đen tối.
Khi họ chạm trán với các thử thách nguy hiểm từ những kẻ thù mới, những bí ẩn đang dần hé lộ: Accelerator và Esther không chỉ là đồng minh tình cờ mà cả hai đều liên kết bởi một sợi tơ duyên phận bí ẩn từ quá khứ. Và giải thoát cho Accelerator không chỉ đơn giản là trốn thoát khỏi khối thời gian, mà còn là tìm ra lý do tại sao anh và Esther lại liên kết với nhau như vậy.
Sự kết hợp giữa sức mạnh vô song, bí ẩn từ quá khứ và tình cảm chưa lời sẽ tạo nên một cuộc phiêu lưu đầy kịch tính và bất ngờ trong Toaru Kagaku No Accelerator phiên bản mới này.
