Trên một con tàu du lịch xa xôi, Conan và các bạn đang tận hưởng kỳ nghỉ. Tuy nhiên, niềm vui của họ nhanh chóng bị đe dọa khi một loạt các vụ án mạng bí ẩn bắt đầu diễn ra. Những nạn nhân đều là những người giàu có và có quan hệ thân thiết với nhau. Conan nhận ra rằng tất cả những vụ án đều có dấu hiệu của một thủ phạm duy nhất, một kẻ hành pháp tài ba với biệt danh "Zero".
Khi các chi tiết khác nhau dần dần hé lộ, Conan phát hiện ra rằng Zero không chỉ là một tên sát thủ thông minh, mà còn là một kẻ có mục tiêu lớn hơn không ai ngờ đến. Đằng sau vẻ nguy hiểm và lạnh lùng, Zero còn là một con người mang trong mình những vết thương tâm lý sâu thẳm. Sự truy đuổi giữa Conan và Zero không chỉ là cuộc đấu trí căng thẳng, mà còn chứa đựng những bí mật kinh hoàng về quá khứ của họ.
