Trong thế giới của "Ông Thầy Vi Diệu", học viện phù thủy Magicoria rộng lớn và ẩn chứa bí mật khủng khiếp từ thời xa xưa. Học sinh nơi đây không chỉ học về phép thuật mà còn phải đối mặt với những thách thức đầy nguy hiểm.
Cuộc thi phép thuật hàng năm đang diễn ra rất sôi động, học sinh năm nhất Ciel đầy tham vọng bất ngờ tiết lộ sở thích "lạ thường" của mình: nghiên cứu về phép thuật hồn ma. Ngày thi cuối cùng, khi Ciel đang chứng minh khả năng của mình bằng một phép thuật cấp SS lẽ ra không được sử dụng, một vụ nổ lớn bất ngờ xảy ra.
Mọi người cho rằng Ciel đã thất bại và bị loại khỏi cuộc thi, nhưng sự thật lại khác hẳn. Một cánh cửa hồn ma màu đen khổng lồ mở ra, phóng ra một luồng khí u ám bao trùm toàn bộ học viện. Những học sinh khác hoảng loạn chạy trốn, nhưng Ciel không sợ hãi và bước vào cánh cửa.
Trên bên kia, một thế giới song song tăm tối và ma quái hiện ra trước mắt Ciel. Một linh hồn bí ẩn tiếp cận và bày tỏ mong muốn hợp tác với cậu để giải quyết một âm mưu đen tối đang gây rối trái đất. Ciel phải đứng lên, sử dụng sức mạnh phi thường của mình và đối đầu với kẻ thù nguy hiểm đến từ bóng tối, để bảo vệ học viện và cả thế giới phù thủy khỏi sự lụi tàn.
