Truyện tranh "Ojisan To Miiko" bắt đầu với cuộc gặp gỡ tình cờ giữa Miiko, một cô nữ sinh trung học tinh nghịch và Ojisan, một người đàn ông lớn tuổi sống cô đơn. Dù khác biệt về tuổi tác và tính cách, họ đã dần tìm thấy sự đồng cảm và hiểu biết trong nhau, tạo nên một tình bạn đầy ấn tượng.
Tuy nhiên, một ngày nọ, bí mật kinh hoàng từ quá khứ của Ojisan bất ngờ được phơi bày. Miiko đã phát hiện ra rằng, Ojisan chính là nhân vật khủng bố từ một vụ đánh bom nổi tiếng đã gây chấn động cả xã hội. Sự sống cô đơn và tự nguyện ẩn dật của Ojisan đều là để tránh sự truy đuổi của công lý và cảm xúc không thể kiểm soát từ quá khứ.
Chấp nhận hiểu biết sự thật đau lòng này, Miiko đối diện với quyết định khó khăn: tiếp tục giữ bí mật và duy trì tình bạn với Ojisan, hay đối diện với công lý để đưa ra quyết định cuối cùng. Điều gì sẽ xảy ra khi sự tình tế lặng giữa họ dần bị thử thách bởi sự hiểu biết và trách nhiệm? Mối quan hệ giữa Miiko và Ojisan sẽ đi về đâu khi tất cả đều dựa vào một bí mật không thể chôn vùi?
