Truyện tranh "Mối tình đầu của tôi là con trai" xoay quanh cuộc sống của cậu học sinh trung học tên Haru. Haru luôn cho rằng mình chỉ thích những cô gái xinh đẹp và dễ thương nhưng một ngày, mối tình đầu của anh lại xuất hiện và là một chàng trai tên Rei - một học sinh mới chuyển đến trường. Sự xuất hiện của Rei đã khiến cuộc sống của Haru bị đảo lộn, những cảm xúc lạ lẫm và mơ mộng lần đầu tiên xuất hiện trong tâm hồn cậu.
Dần dần, Haru nhận ra rằng tình cảm của mình không phải bị giới hạn bởi giới tính hay hình dáng bên ngoài mà là bởi tâm hồn và trái tim của mỗi người. Họ dần hiểu và chấp nhận tình cảm đặc biệt này, vuốt qua những khó khăn và điều hiểu lầm từ mọi người xung quanh. Sự dằn vặt, tìm tòi và học hỏi giữa hai người đã tạo nên một câu chuyện tình đầy động lực và sức mạnh, khiến họ trưởng thành hơn trong tình yêu và cuộc sống.
