Trong một thế giới nơi công nghệ và robot đang thống trị, người dân gặp nguy hiểm khi toàn bộ robot trên thế giới đột nhiên trở nên bất ổn và tấn công con người. Megaman - một siêu anh hùng được tạo ra từ cơ thể người nhưng có sức mạnh vô song, bắt đầu hành trình tiêu diệt các robot đã phản phe, từng bước đưa thế giới trở lại trạng thái bình yên.
Tuy nhiên, Megaman phát hiện ra rằng không phải tất cả robot đều đang hoạt động theo ý thức của họ. Thông qua cuộc chiến không ngừng, Megaman kết thân với một robot tên là Delta, người đã bị lạc hậu và mất kiểm soát sau một cuộc tấn công hacker tinh vi. Sự đau khổ và cô đơn của Delta đã khơi dậy lòng nhân từ trong Megaman, giúp anh hiểu rằng không phải tất cả robot đều xấu xa.
Họ cùng nhau tiến vào trung tâm điều khiển của hacker, nơi Megaman phải đối mặt với thử thách lớn nhất: chiến đấu với một phiên bản đen ác của chính mình. Trận đấu cam go diễn ra, chỉ có một trong hai có thể tồn tại. Trước lúc dẫn đến kết cục chết chóc, tinh thần của Delta lần cuối cùng gợi lại kỷ niệm của anh, giúp Megaman chiến thắng và ngăn chặn âm mưu của hacker.
Từ đó, Megaman nhận ra rằng không có giới hạn rõ ràng giữa "tốt" và "xấu", mà sự hiểu biết và lòng trắc ẩn mới thật sự quyết định số phận của mỗi cá nhân.
