Trong một buổi sáng tại trường trung học Kuroiwa, cô nữ sinh học lớp 10A - Haruka, luôn tỏ ra lạnh lùng và xa cách với mọi người xung quanh. Mặc dù được mọi người gọi là "Medaka", tức là cá chép đen ẩn, nhưng không ai hiểu rõ về vẻ ngoài và tâm hồn phức tạp của cô.
Cuộc sống bình dị của Medaka bỗng chốc bị xáo trộn khi cậu học sinh chuyển trường mới - Kaito, một chàng trai năng động và hóm hỉnh, xuất hiện và quyết định làm bạn với cô. Bất ngờ trước sự gan dạ của Kaito, Medaka bắt đầu mở lòng và dần hiểu ra rằng, đằng sau lớp vỏ lạnh lùng kia, cô cũng là một người có trái tim ấm áp.
Nhưng mọi chuyện chỉ mới bắt đầu khi một bí mật kinh hoàng từ quá khứ của Medaka bắt đầu dần hé lộ. Kaito phải đối mặt với những khó khăn khó lường để bảo vệ người mình yêu thương. Họ cùng nhau vượt qua gian khó, tìm ra sự thật đằng sau bí mật ấy và học được bài học quý giá về tình bạn, tình yêu và sự tha thứ.
Mối quan hệ giữa Medaka và Kaito dần trở nên mạnh mẽ hơn, khi họ tìm thấy sức mạnh từ sự hiểu biết và tin tưởng đồng đội. Với những tình tiết bất ngờ, twist đầy kịch tính, "Kuroiwa Medaka Ni Watashi No Kawaii Ga Tsuujinai" không chỉ là một câu chuyện về tình yêu trong tuổi học trò, mà còn là một hành trình tìm kiếm bản thân và ý nghĩa cuộc sống.
