Trong một đêm tĩnh lặng, cơn mưa rào bất chợt đổ xối xả, cuốn hết mọi dấu vết và bí ẩn giấu kín trong bóng tối. Đội trưởng Conan, một thám tử tài ba đầy bí ẩn, nhận nhiệm vụ điều tra vụ án giết người đầy kỳ lạ tại một khu chung cư cũ kĩ. Nạn nhân, một phụ nữ trẻ tuổi, được tìm thấy chết trong căn phòng phủ mờ bởi màn huyền bí của sự chết chóc. Conan, bằng sự tinh tế và khả năng suy luận hơn người, phát hiện rằng có một tờ giấy báo cũ bị rách nát nằm gọn trong tay nạn nhân.
Qua những manh mối vụ án, Conan phát hiện ra rằng tờ giấy báo đó chứa đựng một thông điệp bí mật, mở ra cuộc truy tìm kẻ giết người đầy khó hiểu. Hồi tưởng vụ án cũ liên quan đến nạn nhân, những đau thương, ân hận và tội lỗi được vạch trần dần hiện hình. Cùng lúc đó, Conan phải đối mặt với những thử thách tâm lý và mối nguy hiểm gần kề, khiến anh phải đặt cược tất cả để phá giải vụ án đầy khó hiểu này, trước khi cơn mưa rào cuốn trôi mọi manh mối.
