Trong một đêm tối u ám, Nobita vô tình phát hiện một chiếc cỗ máy thời gian khác lạ trong căn nhà hẻo lánh ở ngoại ô. Tò mò, cậu bật nó lên và cảm thấy thấy ai kia quét mình vào một không gian kỳ bí.
Không phải trở về quá khứ, Nobita bị cuốn vào một vũ trụ đen tối, nơi những phù thủy học đen tối đang hành hạ và kiểm soát Doraemon. Được biến đổi thành một sinh vật kỳ quái, Doraemon không còn là người bạn đồng hành vui vẻ mà Nobita biết.
Làm thế nào Nobita có thể thoát khỏi thế giới đen tối này và cứu lấy Doraemon khỏi vũ trụ tăm tối? Sự kịch tính và kinh dị bắt đầu khi cậu phải đối mặt với những thử thách khủng khiếp để giải cứu người bạn thân thiết của mình, không chỉ trong vũ trụ hiện tại mà còn ở cái thế giới ma quái đen tối mà Doraemon đang bị giam cầm.
