Trên hành tinh Digital, nhóm bạn Protagonists tận dụng sức mạnh của những Digimon đồng minh để chiến đấu chống lại tổ chức Black Virus – một thế lực đen tối đe dọa sự hòa bình trong thế giới này. Trong khi dấn thân vào cuộc hành trình mới, họ phát hiện ra một bí mật khủng khiếp: Black Virus thực chất là những Digimon bị kiểm soát và biến đổi từ những người dân bí ẩn của thế giới con người.
Quá khứ đen tối của Black Virus dần hé lộ, khiến Protagonists đối mặt với quyết định khó khăn: tiếp tục truy tìm và tiêu diệt hay tìm cách chữa trị và giải phóng họ khỏi sự kiểm soát? Trên con đường chông gai, họ phải đương đầu với nhiều thách thức mới, từ cuộc chiến sống còn với những Digimon Black Virus mạnh mẽ đến những khám phá đau lòng về quá khứ gần gũi. Liệu họ có thể vượt qua và cứu lấy cả hai thế giới khỏi nguy cơ sắp tới?
