Trong khuôn viên của Học Viện Thần Học Phong Linh, những học sinh siêu năng lực luôn tập trung vào việc rèn luyện khả năng siêu phàm của mình. Trong số đó, Dạ Nguyệt - một cô gái với khả năng kiểm soát quang phổ ánh sáng, luôn tự tin và mạnh mẽ trước mọi thách thức. Tuy nhiên, bí mật đậm sâu trong lòng cô dần dần hé lộ khi cô bắt đầu nhận ra mình có một sức mạnh bí ẩn mà ngay cả cô cũng chưa thể hiểu rõ.
Một ngày, khi thế giới thần bí bị đe dọa bởi một phù thủy hắc ám, Dạ Nguyệt phải đối mặt với quyết định khó khăn: hy sinh bản thân để cứu lấy mọi người hay chấp nhận thất bại và chìm trong bóng tối vô tận? Trong lúc tuyệt vọng, cô phát hiện ra một bí mật lớn về quá khứ của mình, từ đó mở ra một loạt các bí ẩn gối ghế, sự thật đằng sau sức mạnh siêu phàm mà cô đang sở hữu.
Dần dần, những hiểu biết mới giúp Dạ Nguyệt mở lòng ra với những người bạn đồng đội và hiểu rõ hơn về chính mình. Truyện tranh Chúng Thần Học Viện không chỉ xoay quanh những trận chiến giữa ánh sáng và bóng tối, mà còn về sự trưởng thành, tình bạn và tình yêu đầy mãnh liệt trong thế giới siêu nhiên đầy bí ẩn này.
