Trên hành tinh Shinobi, tồn tại một biệt đội anh hùng tinh nhuệ được gọi là Biệt Đội Shinobi. Dẫn đầu bởi anh hùng huyền thoại Ronin, đội quân này luôn sẵn sàng chiến đấu chống lại thế lực tà ác đe dọa hòa bình thế giới. Mỗi thành viên trong đội đều là những chiến binh võ thuật siêu phàm, sở hữu sức mạnh và khả năng siêu nhiên đặc biệt.
Trong một trận chiến cam go, Biệt Đội Shinobi bất ngờ bị tấn công bởi một tổ chức bí ẩn mang tên Định Mệnh Đen. Thảm họa ập đến khi Ronin bị bắt cóc, để lại đội quân không chỉ mất lãnh đạo mà còn rơi vào tuyệt vọng. Nhưng thật bất ngờ khi Genji, một thành viên trẻ tuổi nhưng tận tình và thông minh, bất ngờ nổi lên và dẫn dắt Biệt Đội Shinobi đối đầu với Định Mệnh Đen.
Nét cá tính mạnh mẽ và niềm tin vào công lý giúp Genji và Biệt Đội Shinobi vượt qua thử thách đầy cam go, khám phá những bí mật đen tối và chiến đấu để đánh bại kẻ thù, đồng thời tìm cách giải cứu Ronin và khôi phục hòa bình cho hành tinh Shinobi.
