Truyện tranh "Anitomo" xoay quanh cuộc sống học đường đầy rắc rối và ngọt ngào của cô nữ sinh trung học Mei và anh chàng học trưởng cấp trên hay thường gọi một cách thân mật là Ani. Mặc dù bề ngoài Ani lạnh lùng và tâm tư kín đáo, nhưng thực chất anh đã âm thầm che chở và bảo vệ Mei từ sau lưng.
Trong một buổi học môn thể dục, khi mọi người đang tập trung vào việc chạy ba dặm, Mei đột nhiên gặp sự cố với đôi giày bị hỏng. Điều này khiến cô mất tự tin và không thể tiếp tục cuộc chạy. Nhận thấy điều này, Ani nhanh chóng lao đến phía trước, nhấc Mei lên vai mình và bắt đầu chạy với tốc độ nhanh như gió.
Mọi người trên sân tập đều kinh ngạc trước sự quả cảm và tình bạn đặc biệt giữa hai người. Ani không chỉ giữ cho tốc độ chạy của mình ổn định mà còn động viên Mei bằng những lời động viên quả cảm. Cuối cùng, cả hai vượt qua vạch đích cùng nhau, tạo nên một hình ảnh ấn tượng không chỉ với tất cả mọi người mà còn với trái tim của Mei.
Vấn đề bị hỏng giày không chỉ là một sự cố đơn giản mà còn là cơ hội để tình bạn giữa Mei và Ani càng thêm bền chặt. Từ sự việc này, Mei nhận ra rằng có một bí mật ẩn sau vẻ ngoài lạnh lùng của Ani, và câu chuyện tình bạn đầy bi kịch giữa họ bắt đầu bộc lộ dần dần.
